L’EPSM Val de Lys - Artois est administré par un conseil de surveillance présidé par André Flajolet, Maire de Saint-Venant. Le Docteur Bruno Péquignot, psychiatre, préside la Commission Médicale d’Établissement (CME). L’établissement est dirigé par Valérie Bénéat-Marlier.
L’EPSM Val de Lys fait partie du GHT de Psychiatrie du Nord Pas-de-Calais avec L’EPSM Lille-Métropole (Armentières), établissement support, l’EPSM de l’agglomération lilloise (Saint-André-Lez-Lille), l’EPSM des Flandres (Bailleul).